罗定海关

罗定海关是受广州海关直接领导，按授权负责云浮市范围内海关各类属地管理工作的正处级隶属海关，主要负责党的基层建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；完成广州海关交办的其他工作。

河源海关

河源海关是受广州海关直接领导，按授权负责河源市范围内海关各类管理工作的正处级隶属海关，主要负责党的基层建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；完成广州海关交办的其他工作。

中国电子口岸数据中心广州分中心

主要职责：为进出口企业和执法部门提供电子口岸信息服务，电子口岸信息系统运行维护与技术支持，电子口岸安全认证，相关应用软件开发、培训与咨询服务。内设机构：综合部、技术研发部、技术服务部

广州海关技术中心

广州海关办公室（党委办公室）

主要职责：承担党委办公室日常工作。承担文电、会务、机要、值班应急等机关日常运转；承担安全保卫、信息、保密、新闻发布、政务公开、外事、督查督办、辅助参政议政等工作。

广州海关法规处

主要职责：承担规范性文件和重要业务制度的合法性审查工作，承担法治宣传教育、行政审批等法制业务协调工作，承担有关行政复议和行政应诉工作、公职律师管理工作。　　内设科室：综合科、法规管理科、法制协调科、复议应诉科

广州海关综合业务处

主要职责：承担日常业务统筹协调、综合管理事项，落实全国通关一体化相关工作；牵头拟订业务综合发展规划，承办海关技术规范相关工作；协调开展与海关管理相关的技术性贸易措施工作，落实国家禁止或限制进出境货物、物品海关监管制度；推动实施通关流程标准、申报规范、通关运行管理工作；组织实施知识产权海关保护工作；承担重大改革事项的统筹规划和协调落实；牵头口岸管理工作，协调口岸通关中各部门工作关系；牵头贸易管制工作；承办智慧海关业务流程体系建设。

广州海关自贸区和特殊区域发展处

主要职责：落实自由贸易试验区、海关特殊监管区域、保税监管场所发展规划、监管制度，承担自由贸易试验区、海关特殊监管区域、保税监管场所的设立和事中事后监督工作，拟订关区加工贸易等保税业务工作制度并组织实施。